Malaspina cometió el error de criticar a Godoy y fue encarcelado nada más volver

La expedición regresó a Cádiz en septiembre de 1794 con un material científico extraordinario. Malaspina comenzó a preparar la publicación de los resultados. Pero cometió un error fatal: se involucró en política, criticó al todopoderoso ministro Manuel Godoy y fue arrestado en 1795 acusado de conspiración. Condenado a diez años de prisión, sus papeles fueron confiscados y la expedición desapareció de la historia oficial. Los resultados científicos quedaron enterrados en archivos durante décadas. Malaspina fue liberado en 1803 y murió en Italia en 1810, sin haber publicado nada de lo que había descubierto.